Novo vírus de DNA circular identificado em Opuntia discolor (Cactaceae) que codifica proteínas com similaridade às de geminivírus

Estudos de metagenômica viral permitiram a descoberta de muitos vírus desconhecidos e revelaram que as comunidades virais são muito mais diversas e ubíquas do que se pensava anteriormente. Alguns vírus têm múltiplos componentes genômicos que são encapsidados em vírions separados (vírus multipartidos) ou no mesmo vírion (vírus segmentados). Neste estudo, identificamos o que é possivelmente um novo vírus bipartido de DNA circular de fita simples associado a plantas em um cacto palma selvagem, Opuntia discolor, endêmico da ecorregião do Chaco na América do Sul. Dois componentes virais circulares de DNA de ~1,8 kb foram recuperados, um codificando uma proteína associada à replicação (Rep) e o outro uma proteína do capsídeo (CP). Ambas as sequências de proteínas inferidas da Rep e CP são homólogas àquelas codificadas por membros da família Geminiviridae. Esses dois componentes putativamente cognatos têm cada um uma sequência de nonanucleotídeos dentro de uma provável estrutura em grampo que é homóloga às origens de replicação em círculo rolante (RCR), encontradas em diversos vírus de DNA circular de fita simples. Além disso, os dois componentes compartilham sequências iterativas putativamente associadas à replicação (iterons) similares, que em vírus de DNA circular de fita simples são importantes para a ligação da Rep durante o início da RCR. Tais características moleculares fornecem suporte para a possível natureza bipartida deste vírus, que nomeamos vírus utkilio (nome comum da Opuntia discolor na América do Sul) componentes A e B. Nos ensaios de infectividade conduzidos em plantas de Nicotiana benthamiana, apenas o componente A do vírus utkilio, que codifica a proteína Rep, foi encontrado para se mover e replicar sistemicamente em N. benthamiana. Isso não foi verdade para o componente B, para o qual não detectamos replicação, o que pode ter sido devido a esta ser uma molécula defeituosa ou por causa das plantas modelo (N. benthamiana) usadas para os ensaios de infecção. Experimentos futuros precisam ser conduzidos com outras plantas, incluindo O. discolor, para entender mais sobre a biologia desses componentes virais.